法证部高级化验师高彦博(欧阳震华饰)为人博学、冷静、机智,贯彻“毋枉毋纵”的法证精神,带领法证部与警方合作侦破无数案件,不过罪犯手法愈趋高智慧、狡猾,法证部亦要不断精进,务求更科学化、更巧妙、更有效率地找出案件真相,所以法证人员的工作也见日益繁重。非常法医古泽琛(林文龙饰),亦是著名推理小说家“古采尼”,曾经因应其小说而牵引出几件曲折离奇的案件。他借着解剖尸体和活体取证,为死者或受害人说话,把罪案的真相呈现眼前……泽琛和法证部政府化验所技术员林汀汀(钟嘉欣饰)共同经历了一段起伏的感情路,终于有情人终成眷属。身边所有人都为他俩而高兴、祝福。然而,正当泽琛和汀汀筹备婚礼之际,另一边厢的彦博和西九龙重案组督察梁小柔(蒙嘉慧饰)的一段感情,却因为彦博的理性而显得平淡,小柔其实很羡慕泽琛和汀汀的浪漫和激情,虽然知道彦博是用情专一的男人,但也不禁有患得患失之感。一宗牵涉国际毒贩的凶杀案,把毒品调查科高级督察马帼英(佘诗曼饰)介入彦博、泽琛和小柔的合作关系当中。帼英领导毒品调查科两年,是警队中出色的破案高手。小柔办案勇猛过人,每每身先士卒,帼英却属于智慧型审讯高手,每逢审问疑犯前,均会先掌握案情关键,再逼问犯人,令其供出真相。帼英审问手法灵活多变,更会亲自模拟凶案现场环境,以求勾起受害者的记忆,从中找出破案线索。两帮毒贩为了利益而互相厮杀,甚至以炸弹来对付仇家,在一次手榴弹袭击事件中,幸得泽琛的少年好杨逸升(郑嘉颖饰)的偶然出现,化解了一场危机。逸升原来是英国回来的拆弹专家,处事镇定,能承受生死一线的压力,并且曾修读有关毛发研究及血液分析的课程,极有法证触觉。彦博初认识逸升,便认为是个人才,有心吸纳逸升成为法证部一员猛将。而逸升亦屡次见识到彦博利用法证方法与科技于侦破案件的力量,深表佩服,与彦博惺惺相惜。泽琛和汀汀的婚期迫近,二人满怀兴奋地迎接着大喜日子,没想到,毒贩间的炸弹袭击却摧毁了他们的美梦,也毁掉了小柔的未来。一声爆炸的巨响,令汀汀当场炸死,小柔重伤。小柔的右耳被震得失聪、右手神经受损,无奈从重案组的一线上退了下来。汀汀的死带给泽琛极大的伤痛,良久不能平复。事件也令彦博更加珍惜和小柔的缘份,但小柔一直觉得自己付出的感情较彦博多,及后彦博向小柔求婚,小柔已分不清彦博对自己是出于道义、责任还是真爱,对工作及感情均失去自信。为了不让汀汀白死,为了不让犯罪者逍遥法外,彦博、逸升和泽琛誓要不惜任何代价,把杀人者绳之于法!小柔受重伤后,帼英取代小柔的职务,带领重案组追缉凶徒。但帼英的作风令重案组内沈雄、凌心怡等人大为不满,处处与帼英起冲突。以逸升对炸弹的熟悉、泽琛从尸体上获取的答案、彦博从法证上取得的证据,再加上帼英锲而不舍的调查,杀害汀汀的凶徒终难逃法网。而泽琛也终于能从阴影的日子中走出来,重新振作,为了汀汀,坚强地活下去。