阅历了骚动的明治维新,日本迎来新的时代在明治政府第十个年头,不祥的气息弥漫东京。恶德实业家武田观柳(香川照之 饰)操纵女医师高荷惠(苍井优 饰)研制新型鸦片,地下招徕落魄武夫,大肆收买周边土地,有条不紊地完成他的野心勃勃。在此时期,以刽子手拔刀斋之名滥杀无辜的鹈堂刃卫(吉川晃司 饰)惹起了前新選组头目斋藤一(江口洋介 饰)的留意,也迫令隐姓埋名多年的拔刀斋本尊绯村剑心(佐藤健 饰)退场。旅居在神谷道场的绯村渐渐融入神谷薫(武井咲 饰)和周边庶民的平和生活之中。但是武田欲壑难平,为了维护严酷的人,剑心不得不拔出逆刃刀和相乐佐之助(青木高尚 饰)勇闯虎穴……