这是五十年后的未来,世界被“神”吞噬殆尽而荒芜的架空故事。 由于遭到突如其来的怪物“荒神”的破坏而失掉平衡。在人类文明既有的兵器都因荒神的“捕食”天分而有效化下,生化科技企业“芬里尔”成功应用荒神细胞开收回了名为“神机”的生物兵器。并同时组织了特殊部队“GOD EATER”。自此,人类终于取得了与荒神对立的力气。于是,追求知性之极致的荒神,与追求物种延续的人类之间的战争便此展开。在破灭的止境,终究是神会先成为人,还是人会先成为神呢?竞争末尾了。GOD EATER的义务是把接近地下寓居区的荒神击退,并且把荒神的中心和素材带回。在这样的背景下,玩家将会扮演一名神机使,末尾了与死亡擦身而过的每一天。