本作主人公冈部伦太郎(宫野真守配音)是个患有严重中二病的大先生,自称为“凤凰院凶真”的他和同伴们组成了“未来发明研讨所”,在位于秋叶原的一个粗陋实验室内停止各种乖僻发明和调查。 2010年7月28日这天,冈部和两小无猜真由理(花泽香菜配音)一同去了迷信讲义会场,在那里,他们遇见了天赋少女牧濑红莉栖(今井麻美配音)。让人意想不到的事情发作了,冈部在会馆楼道内听到一声惨叫,他闻声而至,发现了倒在血泊中的牧濑。冈部用手机短信将这件事通知好友桥田至,这个举动,让世界都推翻了。实验室里那个所谓的“未来道具”,居然真的可以左右世界的进程,冈部自此成了孤独的观测者。 这一切都是命运石之门的选择。