公元2035年,人类被12只猴子军研制的一种病毒侵袭,大局部人类都在这场病毒灾难中死亡,只要少数人幸运逃生,但也只能在阴暗的地下,苟且偷生。 迷信家们决议派人穿越光阴回到1996年清查12只猴子军的来历。囚徒詹姆斯·科尔(布鲁斯·威利斯BruceWillis饰)被挑选为志愿者。鬼使神差,科尔回到了1990年,当他向事先的人们描画未来的那场大灾难时,被当作肉体病捉了起来并被医生凯瑟琳·雪莉(玛德琳·斯通MadeleineStowe饰)诊断为肉体分裂症。科尔在病友杰弗里·戈因斯协助下逃脱,回到了未来。由于没查清12只猴子军的来历,科尔再次被派回了1996年。 科尔这次发现了12只猴子军的来源地在费城,他找到了医生凯瑟琳,二人一同展开了清查12只猴子军的冒险之旅!