第二季的故事将从上一季最后一集的情节拉开帷幕。警视厅搜索一科“特别立功对策室”自愿解散,室长大泽绘里子(天海佑希饰)引咎辞职,预备从成田机场动身回去美国,可是就在机场等候时她接到了野立信次郎(竹野内丰饰)的电话。警界高官黑原健蔵将成为反政府组织“黑月”的下一个狙击目的,而“黑月”重要成员高仓龙平在护送中逃脱。虽然绘里子和对策室各成员纷繁赶往现场,但黑原依然中弹,而犯人逃脱。身负重伤的黑原自愿辞职,为了承当责任,对策室再度解散,绘里子去了美国。两年后,当上参事官的野立以接手某个重要案件为契机,使得对策室再度复生。木元真实(户田惠梨香饰),片桐揣摩(玉山铁二饰),花形一平(沟端淳平饰),山村启辅(温水洋一饰)和岩井善治(小林友治饰),这一班乌合之众能否还能再次聚首,为绘里子和对策室效能?而野立这一次能否依然可以压服绘里子担任室长一职?