某年的圣诞夜,大量大众凑集到某栋大厦门外,抗议国度与库赞共和国的纯净水互助打算。与此同时,交通网络以及相干电子体系遭到入侵而全面失灵,随后更有保持治安的警察掏枪射击抗议大众。值此危急时刻,公安九课少校的草薙素子(坂本真绫配音)带领队员巴特(松田健一郎配音)、陀古萨(新垣樽助配音)等人快速展开举动,与可怕分子和黑客展开连番恶斗。这支本性满满且身怀绝技的灵活军队,还要追溯到2027年6月的某天。时任陆军秘密军队501机关中佐的真室在街头被人杀戮,公安9课课长荒卷大辅(塾一久配音)在墓地与生化人草薙素子首次邂逅。后者接收荒卷的委托追查本相,在这一进程中和巴特等人邂逅。这正是一段传奇军队“攻壳灵活队”建立前夕的故事…… 本片依据士郎正宗的原作改编。