奈叶(田村由香里配音)本是一位平常的小学三年级女生,却因为意外遇见了来自异世界的尤诺而成为了魔法少女,投入到了争取遗产的战役之中。在上一次事件停止之后,奈叶离别了与之结下深厚友情的菲特(水树奈奈配音),重新回归了安静的日常生涯,接收着魔力训练,以防范仇人的下一轮激烈袭击。 某日,一个神秘的魔法结界呈现在了海鸣市的上空,这不寻常的现象吸引了奈叶的注意。果不其然,奈叶遭到了红发魔法少女维塔(真田麻美配音)的打击,让奈叶没有想到的是,维塔竟然一下子就损坏了奈叶牢固的防备。所幸菲特及时呈现,奈叶才幸免于难,而维塔的呈现意味着,有一场诡计正在机密展开。