曾经有一场被称作“厄祭战”的大型战斗。那场战斗终结后过了约莫300年。 地球圈失去了至今为止的统治机构,在新的安排系统下,新世界被构筑起来。一时的宁静到来,与此同时,远离地球的火星圈燃起了新战斗的火种。 主人公——少年三日月·奥古斯,从所属的民间警备公司克律塞安保公司(下称CGS)那里,接收了盘算让在地球权势统治下的火星都市独立的少女库德莉亚·蓝那·伯恩斯坦的保护义务。但,CGS受到摘取反水之芽的武力组织加拉尔霍恩的袭击,于是在把三日月这些孩子当做钓饵后退却了。少年们的领袖,奥尔加·伊兹卡以为这是个机遇,并决议对虐待自己的大人们掀起反旗。被奥尔加托付击退加拉尔霍恩的三日月,应用被当做CGS动力炉来应用的“厄祭战”时期的灵活战士——高达·巴巴托斯,向敌军提倡挑衅。