独眼之男时间是天文4年(1535年),山本勘助的名字还是大林勘助的时候,他那时还只不过是一个为学习研究兵法而周游诸国,不停修行的流浪武士。结束了15年的旅行后,勘助为继任家督之位准备赶回故乡三河。赶路途中,勘助经过甲斐国的一个贫穷村庄葛笠村,结识了农民家的女儿美津和平藏两人。当时,甲斐国终于在信玄的父亲武田信虎的努力下成功统一,而且武田信虎正在尽力拓展甲斐的势力,与骏河的今川和相模的北条处于敌对状态中。武田和今川的争斗把无辜的农民们卷入了战争,葛笠村也遭受到今川散兵的袭击。为了救助美津,勘助与一名蒙面男子进行了激烈的剑戟战,跟他结下了怨仇。这名男子正是假扮今川士兵的武田家臣。另一方面,在武田家的主力与今川对峙期间,北条氏康趁机攻打甲斐,武田军珠江板垣信方率军迎击。勘助前去观看武田军和北条军的战事,不料非要跟来的美津竟然被北条的武将捕获……