巧妙的EVA零号机驾驶员绫波丽,在与碇元度商定之时,分开了NERV底层中央教条的白色水池边。她的命运似乎就将在此终了。 在危殆时辰,葛城美里不但要完成加持良治交待的对“第二次浩劫”真相以及“人类补完方案”的探查义务,还要维护碇真嗣与明日香,以及防范SEELE 对初号机与二号机的物理接触。 出于对碇元度的憎恨,赤木律子接受了SEELE引爆MAGI的提案,她能否成功?暂时与SEELE同事的碇元度、冬月耕造、碇唯,为了防止人类“最终的喜剧”,而酝酿了的“人类补完方案”能否完成?尽在《新世纪福音战士》电影版第2部中解答。