金鱼姬是一条活跃好动的小鱼,一次偶然的机遇,它在涨潮时被冲进了玻璃瓶中无法脱身。此时,恰好来海边度假的男孩宗介路过,帮它解困,今后人鱼相识。宗介把金鱼抱回家里豢养,一起玩耍,情感甚笃。由于海员父亲终日出航,宗介只得跟母亲相依为命,这让他的性情孤介自闭,甚至对尊长也不理不睬。但是,遇到金鱼姬后,宗介逐渐转变了对生涯的冷淡态度,这也让他慢慢修复了性情中的缺点。一次意外的海啸中,宗介撞伤了身材,金鱼姬感染到了人类的血,飘回了大海之中。本来海洋中另有另外一个世界,那里有个操控水文情况的怪僻男子藤本,因为发明了人类污染情况的丑恶,所以自造了另一个水中世界。他发明金鱼姬感染了人气,正筹备用魔法将它打回本相,却事与愿违……