明朝成化年间,朝纲糜烂,奸邪当道。西厂东厂为宦官把持,混杂黑色,陷害忠良,朝野内外夸夸其谈。时有赵怀安(李连杰饰)等逃亡剑客自告奋勇,接连根除东厂数名奸佞,致令阉贼提心吊胆。适值此时,风头正劲的西厂督主雨化田(陈坤饰)出面干预。另一方面,宫女素慧容(范晓萱饰)怀有身孕,绝命奔逃。被雨化田的爪牙追捕途中幸得奥秘侠客凌雁秋(周迅饰)相救。二人一路辗转逃往关外,离开曾经惹起过腥风血雨的龙门客栈落脚。龙门客栈一如往昔,为凶险异常之所在。雨化田手下追逐至此,与先前而至的鞑靼商队一触即发,关键时辰更有与雨化田长相极端相似的卜仓舟(陈坤饰)与女侠客顾少棠(李宇春饰)投宿客栈。不久,赵怀安一众也偷偷潜至龙门。各方权利云集于此,新的正邪之战行将展开,更有天大的秘密行将揭开……