谁也不曾想过,七十年前那期奥秘的罗斯威尔事情,时至昔日仍对全体人类发生着如此庞大的影响。并且鲜少有人窥见真相的全貌,即使它就在那里。某天,过着颓丧生活的前联邦探员福克斯·穆德(大卫·杜楚尼DavidDuchovny饰)以及他最为信任的伙伴——正在某某教会医院担任医师的丹娜·斯科莉(吉莲·安德森GillianAnderson饰)重新聚在一同。原来一档旨在揭露政治黑幕节目的掌管人找到他们,希望二人披露政客应用外星人来控制人类的真相。以此为契机,封锁已久的X档案重新开启。一度对各种新奇事情失掉决计的穆德,在斯科莉的陪伴下重新踏上征程。 而这一路上,层层隐藏起来的真相以及人类可怕的未来,将相继呈如今他们的眼前……